区别在于祭祀的神明不同，文庙祭祀孔子及其弟子，而武庙祭祀历代名将。

文庙，祭祀孔子的地方，也称“文宣王庙”。

武庙，与文庙对应，祭祀武将的地方，也称“武城王庙”。

文庙从始至今，主神一直都是孔子。但武庙主神，却先后有三个。

唐玄宗先追封孔子为文宣王，后追封姜子牙为武成王，并正式建武庙。姜子牙成为第一代武庙主神。

岳飞为第二代武庙主神。

清康熙尊关羽为夫子，与孔子并称文武夫子。雍正追封关羽为武圣，成为第三代武庙主神。

民国时，推行关岳同祀，并称武圣。关羽和岳飞并列武庙主神。